ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЕ ВАРИАНТЫ ГЕНОВ ИММУННОГО ОТВЕТА, АССОЦИИРОВАННЫЕ С ТЯЖЕСТЬЮ COVID-19 ИНФЕКЦИИ У ДЕТЕЙ
DOI: 10.22138/2500-0918-2025-22-4-369-378
УДК: 616.9:578-06:616.98:578.834.1-097-053.3
Д.С. Василькова, А.Ю. Пищальников, О.С. Абрамовских, М.А. Зотова
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Южноуральский государственный медицинский университет» Минздрава России,
г. Челябинск, Российская Федерация
Резюме. Несмотря на окончание пандемии, изучение предрасположенности к тяжелому течению COVID-19 не теряет своей актуальности. Инфекция отличается выраженным клиническим полиморфизмом, зависящим от многих факторов, в том числе от возрастных особенностей иммунитета. У взрослых пациентов уже накоплена большая база данных однонуклеотидных вариантов (single nucleotide variants – SNV) различных биохимических процессов, ассоциированных с тяжелым течением инфекции. Подобные исследования у детей могли бы быть полезными, поскольку детский возраст является протективным фактором в отношении тяжелого течения заболевания. Возможно, определение ассоциации некоторых SNV у пациентов детского возраста с различной степенью тяжести COVID-19 позволит внести вклад в изучение генетически детерминированных функциональных особенностей иммунитета, а также оценить влияние заболевания на иммунную систему, в том числе вероятность развития постинфекционной иммунной патологии. Цель исследования – изучить ассоциацию SNV LINC01497/EDN1_1800541; PAD4_rs2240335; CRP_rs1800947; IL10_rs1800872; IL1B_rs1143634; GSTP1; TMPRSS2_rs2070788; NOS3_rs1799983; VEGF_rs699947; PTPN22_rs2476601 с различной степенью тяжести COVID-19 у детей Челябинской области. Материалы и методы. Исследование SNV было проведено в периферической крови 185 детей с различной степенью COVID-19 методом ПЦР в режиме реального времени. Статистическая обработка полученных данных проведена согласно алгоритму SNP-HWE с использованием программного пакета PLINK. Результаты продемонстрировали ассоциацию CRP_rs1800947, IL1B_rs1143634, PTPN22_rs2476601, PAD4_rs2240335 с тяжелым и среднетяжелым клиническим вариантом COVID-19 у детей.
Ключевые слова: COVID-19 дети, rs2240335, rs1800947, rs1143634, rs2476601, новая коронавирусная инфекция
Конфликт интересов отсутствует.
Контактная информация автора, ответственного за переписку:
Василькова Диния Сиябековна
diva2905@mail.ru
Дата поступления: 24.04.2025
Образец цитирования: Василькова Д.С., Пищальников А.Ю., Абрамовских О.С., Зотова М.А. Однонуклеотидные варианты генов иммунного ответа, ассоциированные с тяжестью COVID-19 инфекции у детей [Электронный ресурс] Вестник уральской медицинской академической науки. 2025, Том 22, № 4, с. 369–378, DOI: 10.22138/2500-0918-2025-22-4-369-378
ЛИТЕРАТУРА
1. Guo H, Ha S, Botten JW, Xu K, Zhang N, An Z, Strohl WR, Shiver JW, Fu TM. SARS-CoV-2 Omicron: Viral Evolution, Immune Evasion, and Alternative Durable Therapeutic Strategies. Viruses. 2024 Apr 28;16(5):697. doi: 10.3390/v16050697. PMID: 38793580; PMCID: PMC11125895.
2. Fajgenbaum D.C. et al. Cytokine storm. N Engl J Med. 2020;383(23):2255-73. doi:10.1056/NEJMra2026131
3. Merad M. et al. The immunology of COVID-19. Nat Rev Immunol. 2022;22(2):81-96. doi:10.1038/s41577-021-00652-1
4. Fricke-Galindo I. et al. Genetic susceptibility to severe COVID-19. Front Med (Lausanne). 2021;8:702349. doi:10.3389/fmed.2021.702349
5. Severe Covid-19 GWAS Group. Genomewide association study of severe Covid-19 with respiratory failure. Nature. 2020;583(7818):E20. doi:10.1038/s41586-020-2580-9
6. Castagnoli R. et al. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection in children and adolescents: a systematic review. JAMA Pediatr. 2020;174(9):882-9. doi:10.1001/jamapediatrics.2020.1467
7. Hoang A. et al. COVID-19 in 7780 pediatric patients: a systematic review. EClinicalMedicine. 2020;26:100527. doi:10.1016/j.eclinm.2020.100527
8. Brodin P. Immune determinants of COVID-19 disease in children. Nat Rev Immunol. 2022;22(5):291-307. doi:10.1038/s41577-022-00706-6
9. Woodruff M.C. et al. Autoantibodies in COVID-19 survivors with post-acute sequelae. Nat Immunol. 2022;23(1):40-9. doi:10.1038/s41590-021-01066-3
10. Knight J.S. et al. The intersection of COVID-19 and autoimmunity. Arthritis Rheumatol. 2023;75(5):664-72. doi:10.1002/art.42404
11. Sadeghi Mofrad S. et al. The death rate of COVID-19 infection in different SARS-CoV-2 variants was related to C-reactive protein gene polymorphisms. Sci Rep. 2024;14:703. doi:10.1038/s41598-024-51422-y
12. Rodrigues T.S. et al. Inflammasomes are activated in response to SARS-CoV-2 infection and are associated with COVID-19 severity in patients. J Exp Med. 2021;218(3):e20201707. doi:10.1084/jem.20201707
13. Arveiler B. et al. PADI4 polymorphisms and rheumatoid arthritis susceptibility: a meta-analysis. Rheumatology (Oxford). 2022;61(8):3195-204. doi:10.1093/rheumatology/keac045
14. Sanches E. et al. Genetic variants associated with severe COVID-19 in children: a multicenter study. Pediatr Res. 2023;93(4):1046-53. doi:10.1038/s41390-022-02345-7
15. Chang C.C. et al. Second-generation PLINK: rising to the challenge of larger and richer datasets. Gigascience. 2015;4:7. doi:10.1186/s13742-015-0047-8
16. Solé X. et al. SNPStats: a web tool for the analysis of association studies. Bioinformatics. 2006;22(15):1928-9. doi:10.1093/bioinformatics/btl268
17. Hammer Ø. et al. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontol Electron. 2001;4(1):9.
18. Smilowitz N.R. et al. C-reactive protein and clinical outcomes in patients with COVID-19. J Am Heart Assoc. 2021;10(16):e021475. doi:10.1161/JAHA.121.021475
19. Sefik E. et al. Inflammasome activation in infected macrophages drives COVID-19 pathology. Nature. 2022;606(7914):585-93. doi:10.1038/s41586-022-04802-1
20. Zhang Y. et al. IL-1β polymorphisms and severe COVID-19: a meta-analysis. Front Genet. 2023;14:1132456. doi:10.3389/fgene.2023.1132456
21. Burn G.L. et al. The role of PTPN22 in immune regulation. Nat Rev Immunol. 2022;22(12):747-61. doi:10.1038/s41577-022-00756-w
22. Thiam H.R. et al. NETosis: mechanisms and implications. Nat Rev Mol Cell Biol. 2023;24(5):337-54. doi:10.1038/s41580-022-00554-4
23. Zuo Y. et al. Neutrophil extracellular traps in COVID-19. Sci Transl Med. 2021;13(603):eabd3876. doi:10.1126/scitranslmed.abd3876
24. Velavan TP, Pallerla SR, Rüter J, Augustin Y, Kremsner PG, Krishna S, Meyer CG. Host genetic factors determining COVID-19 susceptibility and severity. EBioMedicine. 2021 Oct;72:103629. doi: 10.1016/j.ebiom.2021.103629. Epub 2021 Oct 13. PMID: 34655949; PMCID: PMC8512556.Andolfo I. et al. Genetic variability in NOS3 and ACE2 genes and COVID-19 severity. EBioMedicine. 2021;70:103507. doi:10.1016/j.ebiom.2021.103507
Авторы
Василькова Диния Сиябековна
Кандидат медицинских наук, доцент, доцент кафедры педиатрии Института дополнительного профессионального образования
diva2905@mail.ru
Пищальников Александр Юрьевич
Доктор медицинских наук, профессор, заведующий кафедрой педиатрии Института дополнительного профессионального образования
pau6277@yandex.ru
Абрамовских Ольга Сергеевна
Доктор медицинских наук, доцент, заведующий кафедрой клинической лабораторной диагностики
abramoschel@mail.ru
Зотова Мария Александровна
Кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник Научно-исследовательского института иммунологии
zotova.chel@mail.ru
ФГБОУ ВО «Южноуральский государственный медицинский университет» Минздрава Российской Федерации
Челябинск, Российская Федерация