Филогения и жирнокислотный состав staphylococcus epidermidis RS105 – изолята из пенных продуктов флотационного обогащения калийных минералов
УДК 579.861.2:575.86
Реутских Е.М., Саралов А.И.
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН, г. Пермь, Россия
Резюме.
Три штамма стафилококков (RS105, RS109, RS110) выделены из пенных продуктов и твердых отходов производственных участков флотационного обогащения калийных минералов СКРУ-2 и СКРУ-3 ОАО «Уралкалий» (г. Соликамск, Пермский край). Изолят RS105 из пенных продуктов флотации СКРУ-3 несколько отличается от других двух близкородственных изолятов RS109, RS110 из твердых отходов флотации СКРУ-2: по значению Г+Ц в ДНК (31-32 мол. %) на 0.4–0.6 мол. % и на 7–12% по ДНК-ДНК гомологии, по способности более активно расти в анаэробных условиях (тиогликолят, нитраты) и гидролизовать казеин и крахмал. Важной особенностью штамма RS105 является его способность адаптивно изменять состав клеточных жирных кислот (ЖК). При аэробном росте колоний на поверхности агаризованной среды с 3% NaCl при 37оС клетки содержат в основном разветвленные ЖК с нечетным числом атомов углерода С15:0 и С17:0 (77% от суммы ЖК). Однако на жидкой среде при совместном действии трех факторов (при понижении температуры до 22оС, дефиците растворенного кислорода, повышении концентрации NaCl до 12%) в их составе преобладают разветвленные ЖК с четным числом атомов углерода С16:0 и С18:0 (62%) и появляются ненасыщенные ЖК С18:1, С18:2, С16:1. Согласно филогенетическому анализу данных секвенирования гена 16S рРНК, совокупности генотипических и фенотипических признаков, изученный умеренно галотолерантный, факультативно анаэробный, чувствительный к новобиоцину изолят RS105 определен как штамм Staphylococcus epidermidis RS105 (JX045648).
Ключевые слова:
галотолерантные бактерии, Staphylococcus epidermidis, клеточные жирные кислоты, ген 16S рРНК, филогенетический анализ
Авторская справка
Реутских Екатерина Михайловна, e-mail: reutskix@mail.ru
Саралов Александр Иванович, e-mail: saralov@iegm.ru
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения РАН, г. Пермь
Россия, 614081, Пермь, ул. Голева, 13